C'est un précurseur pour la synthèse de l'histamine, une substance chimique qui agit comme un neurotransmetteur et est impliquée dans les réponses allergiques et immunitaires. L'histidine est capable de se lier à certains ions métalliques, comme le zinc et le fer. Ces interactions sont importantes notamment pour le transport et le stockage des métaux dans le corps. L'histidine possède un groupe ionisable à son extrémité, ce qui lui permet de jouer un rôle dans le maintien du pH optimal dans divers environnements biologiques, tels que le sang et les cellules. 

Les sources alimentaires riches en histidine comprennent les viandes, le poisson, les produits laitiers, les oeufs, les noix et les légumineuses.