Dans le cas de Claviceps purpurea, un champignon pathogène des céréales, les sclérotes sont associés à la formation d'ergots sur les épis de blé, d'orge ou d'autres céréales. Les ergots contiennent des sclérotes qui peuvent produire des spores fongiques toxiques lorsque les conditions sont favorables, causant ainsi des maladies telles que l'ergotisme chez les animaux et les humains. Les sclérotes sont également utilisés comme mécanismes de propagation et de dissémination des champignons dans l'environnement, leur permettant de survivre dans des conditions difficiles et de coloniser de nouveaux habitats lorsque les conditions sont propices.