La mérogonie  implique une série de divisions cellulaires multiples (schizogonie) qui se produisent à l'intérieur de la cellule hôte, généralement des cellules du système immunitaire ou des cellules du foie chez l'hôte vertébré. Ces divisions cellulaires produisent un grand nombre de mérozoïtes, qui sont des formes infectieuses capables d'envahir de nouvelles cellules de l'hôte ou de se transformer en d'autres formes du parasite, selon l'espèce. 

La mérogonie est souvent suivie par une phase de gamétogonie, où les mérozoïtes se développent en gamétocytes, des cellules sexuelles qui sont nécessaires à la reproduction sexuée du parasite dans son hôte définitif, souvent un vecteur arthropode tel que le moustique pour Plasmodium.