Il existe de nombreux types différents d'oxydases, chacune catalysant des réactions spécifiques impliquant différents substrats. Par exemple, la cytochrome c oxydase est une oxydase impliquée dans la chaîne respiratoire mitochondriale, tandis que la monoamine oxydase est impliquée dans le métabolisme des neurotransmetteurs. 

Les oxydases utilisent souvent des cofacteurs pour faciliter leurs réactions enzymatiques. Ces cofacteurs peuvent être des ions métalliques, des groupes prostétiques ou des coenzymes. Par exemple, la cytochrome c oxydase utilise le cuivre et le fer comme cofacteurs pour catalyser la réaction d'oxydation dans la chaîne respiratoire.

Ces enzymes sont impliquées dans  la production d'énergie dans les mitochondries, la dégradation des substrats dans le cytoplasme, la biosynthèse de diverses molécules, la défense contre les radicaux libres et les toxines, et la régulation du métabolisme.