Dans le contexte humain, la néoténie est parfois évoquée pour expliquer certaines caractéristiques physiques humaines qui semblent être juvéniles même chez les adultes. Par exemple, la taille relativement grande du crâne humain par rapport au reste du corps, les proportions du visage et d'autres caractéristiques peuvent être considérées comme des traits néoténiques. Certains scientifiques ont même suggéré que la néoténie a joué un rôle dans l'évolution humaine, contribuant à notre intelligence et à d'autres caractéristiques distinctives. 

La néoténie peut permettre à une espèce de conserver des caractéristiques juvéniles qui sont adaptatives dans certaines conditions environnementales. De plus, elle peut également faciliter la domestication, car les caractéristiques juvéniles peuvent être perçues comme plus « mignonnes » ou moins menaçantes par les humains, favorisant ainsi la cohabitation avec l'espèce domestiquée.