Dans un groupe monophylétique, tous les membres sont inclus, et seuls ces membres sont inclus. Cela signifie qu'aucun taxon extérieur à ce groupe n'est inclus dans la définition du groupe. En d'autres termes, le groupe est complet et exclusif. La monophylie est fondamentale pour la classification phylogénétique, qui vise à regrouper les organismes en groupes qui reflètent leurs relations évolutives. Les clades, qui sont des groupes monophylétiques, constituent les unités de base de cette classification. 

La reconnaissance des clades monophylétiques permet une classification cohérente et basée sur les relations évolutives entre les organismes. Les méthodes d'inférence phylogénétique, telles que l'analyse cladistique et la construction d'arbres phylogénétiques, sont utilisées pour identifier et définir les groupes monophylétiques. Ces méthodes analysent les caractères partagés entre les organismes pour déterminer les relations évolutives et identifier les clades monophylétiques.