Frederik Kaiser fut aussi, à partir de 1840, professeur d'astronomie à l'université. II est l'auteur de remarquables travaux sur les étoiles doubles, sur les comètes et sur la mesure des planètes. On lui doit notamment la détermination du diamètre équatorial, du diamètre polaire et de l'aplatissement de Jupiter, de la durée de rotation de Mars et du diamètre de Mercure. 

En bibliothèque - Outre un nombre considérable de mémoires et de notes, insérés pour la plupart dans les Annales de l'observatoire de Leyde et dans les Astronomische Nachrichten, il a publié une Astronomie populaire, en hollandais (3e éd., Amsterdam, 1860, 2 vol. trad. franç. et allem.); Geschichte der Ptanetentdeckungen (Amsterdam, 1851), etc.