Elle naît à 60 km au Nord-Ouest de Cracovie sur le plateau calcaire de la Pologne méridionale, descend vers le Nord en décrivant des sinuosités, entre à Zalecze dans une plaine marécageuse, passe à Sierads, à Warta, reçoit le Ner (droite) et, tournant à l'Ouest près de Kolo, s'engage dans une dépression tourbeuse; elle baigne Konin, Pyzdry, reçoit, à gauche, la Prosna (g.), puis passe en Posnanie, où elle arrose Schrimm, Poznan (Posen), Birnbaum, Schweria, reçoit l'Obra et achève son cours dans l'Oder à Kostrzyn (Küstrin), à l'Est de Berlin.

Son lit est canalisé depuis 1786 afin de drainer la dépression marécageuse où il divaguait autrefois. La Warta est navigable sur 434 km à partir de Konin.