Photophore

Certains organismes utilisent la bioluminescence de leurs photophores pour communiquer avec d'autres membres de leur espèce (signaux d'alarme,  signaux de parade nuptiale, signaux de reconnaissance entre individus). Chez certains organismes, les photophores sont utilisés pour produire des contre-éclairages ou des motifs lumineux qui aident à camoufler l'animal en le rendant moins visible aux prédateurs ou aux proies. Certaines espèces utilisent la bioluminescence pour attirer leurs proies. Par exemple, certaines espèces de poissons des abysses utilisent leurs photophores pour simuler des proies pour attirer d'autres poissons à portée de leurs mâchoires. 

Dans certains cas, la bioluminescence peut être utilisée comme moyen de défense contre les prédateurs. Par exemple, certains calmars et certains poissons produisent une lumière vive lorsqu'ils sont attaqués, ce qui peut désorienter ou aveugler leurs agresseurs. Les photophores varient considérablement en taille, en forme et en disposition selon les espèces. Certains organismes peuvent avoir des photophores répartis sur tout leur corps, tandis que d'autres en ont seulement quelques-uns situés dans des zones spécifiques. La bioluminescence des photophores est souvent contrôlée par des mécanismes neuronaux qui peuvent être déclenchés par des signaux environnementaux ou internes.