La classification des Hémicordés.
Les Hémicordés sont divisés en deux classes principales : les Enteropneustes et les Pterobranches.

Les Entéropneuses. 
Le groupe des Entéropneustes est souvent désigné sous le nom de « vers à trompe » en raison de la caractéristique principale de leur anatomie, une trompe ou proboscis qui dépasse de leur tête. Les Entéropneustes possèdent une structure interne qui ressemble à une notochorde primitive. Cette structure, appelée stomochorde, est située dans le tronc. Ils ont un corps segmenté, composé de trois parties principales : le proboscis (ou trompe), le collier et le tronc.  Ils  respirent en absorbant l'oxygène dissous dans l'eau à travers leur surface corporelle et leur proboscis. Ils se nourrissent principalement de matière organique présente dans les sédiments marins, qu'ils ingèrent en filtrant l'eau à travers leur proboscis. Les Entéropneustes se reproduisent généralement sexuellement. Les oeufs fécondés se développent en larves qui subissent une métamorphose pour devenir des adultes.

Les Ptérobranches.
Les Ptérobranches sont un groupe relativement obscur d'organismes marins. À l'intérieur de leur corps, les Ptérobranches possèden une cavité branchiale, un tube digestif et un cordon nerveux dorsal. Cependant, leur anatomie est simplifiée par rapport à celle des Cordés, et ils ne possèdent pas de véritable colonne vertébrale ou de notochorde développée. Ils vivent généralement dans des environnements océaniques profonds et se trouvent souvent sur des substrats tels que des coquilles de mollusques ou d'autres débris marins. Leur morphologie est souvent en forme de branches ou de plumes, ce qui leur donne une apparence caractéristique. Ce sont des organismes filtreurs. Ils utilisent des structures branchiales spécialisées pour filtrer les particules organiques en suspension dans l'eau. Ces particules constituent leur principale source de nourriture, et ils sont capables de capturer des planctons et d'autres petites proies à l'aide de leurs branchies. Les détails spécifiques de la reproduction des Ptérobranches ne sont pas bien compris, mais ils sont généralement considérés comme ayant une reproduction sexuée. Les oeufs fécondés se développent en larves planctoniques qui se dispersent dans l'océan avant de se transformer en adultes.